ด้านปฏิบัติการ มีหน้าที่รับผิดชอบแบ่งได้ดังนี้

การควบคุมจราจรทางอากาศเขตประชิดสนามบิน (Approach Control) มีหน้าที่และความรับผิดชอบในการควบคุมจราจร และจัดการจราจรทางอากาศ เพื่อนำอากาศยาน เข้า-ออก และบินผ่านในพื้นที่ความรับผิดชอบบริเวณโดยรอบสนามบินระยะ 50 ไมล์ทะเล (1 ไมล์ทะเลเท่ากับ 1.852 กิโลเมตร) ระยะสูง 16,000 ฟุต

ส่วนควบคุมจราจรทางอากาศที่รับผิดชอบการให้บริการเขตประชิดสนามบิน 4 เขตดังนี้

• เขตสมุย (Samui Sector) รับผิดชอบเขตประชิดสนามบินสุราษฎร์ธานี, สมุย, นครศรีธรรมราช, ชุมพร และตราด
• เขตขอนแก่น (Khonkaen Sector) รับผิดชอบเขตประชิดสนามบินขอนแก่น, อุดรธานี, สกลนคร, นครพนม และเลย
• เขตอุบลราชธานี (Ubon Sector) รับผิดชอบเขตประชิดสนามบินอุบลราชธานี, นครราชสีมา, บุรีรัมย์, ร้อยเอ็ด, และสุรินทร์
• เขตเชียงราย (Chiang Rai Sector) รับผิดชอบเขตประชิดสนามบินเชียงราย, เพชรบูรณ์, น่าน และแพร่

โดยมีการประสานงานกับหน่วยงานที่เกี่ยวข้อง คือศูนย์ควบคุมจราจรทางอากาศ (Bangkok Area Control Center) และหน่วยควบคุมจราจรทางอากาศเขตบริเวณสนามบิน (Aerodrome Control) หรือหน่วยงานอื่นที่มีเขตประชิดกับพื้นที่รับผิดชอบแล้วแจ้งเตือนนักบินให้ใช้เส้นทางบิน เข้า-ออก หรือบินผ่านตามวิธีการหรือข้อกำหนด ตลอดทั้งการให้ข้อมูลของสภาพทั่วไปของสนามบิน เช่น ข่าวอากาศการบิน และข่าวเกี่ยวกับสภาพสนามบิน นอกจากนั้นการจัดอันดับการเข้า – ออก ของอากาศยาน ณ ท่าอากาศยาน เพื่อให้เกิดความรวดเร็ว และปลอดภัยต่ออากาศยาน ด้วยการใช้ระบบ/อุปกรณ์สื่อสารการเดินอากาศ และอุปกรณ์อื่นๆที่เกี่ยวเนื่องในการติดต่อประสานงาน

การควบคุมจราจรทางอากาศตามเส้นทางบิน (Area Control) มีหน้าที่และความรับผิดชอบในการควบคุมจราจรทางอากาศให้กับอากาศยาน ตามเส้นทางบินทั่วอาณาเขตของประเทศไทย และพื้นที่ที่ได้รับมอบหมายพิเศษ ในต่างประเทศ ได้แก่ น่านฟ้าบางส่วนเหนือเขตทะเลจีนใต้ (Bangkok Area of Responsibility : AOR)

สามารถแบ่งการควบคุมได้เป็น 8 ส่วน (Sectors) คือ

• Sector 1 ครอบคลุมภาคกลางตอนล่าง
• Sector 2 ครอบคลุมภาคตะวันออกเฉียงใต้
• Sector 3 ครอบคลุมภาคตะวันออกแถบจันทบุรี อ่าวไทยบางส่วน
• Sector 4 ครอบคลุมฝั่งตะวันตก ภาคเหนือตอนล่างและภาคกลางตอนบนของประเทศไทย
• Sector 5 และ 6 ครอบคลุมภาคใต้ฝั่งอ่าวไทยและภูเก็ต
• Sector 7 ครอบคลุมภาคเหนือตอนบนและภาคตะวันออกเฉียงเหนือบางส่วน
• Sector 8 ครอบคลุมภาคตะวันออกและตะวันออกเฉียงเหนือทั้งหมด